Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms