Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms