Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPS1Q13098 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms