Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms