Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms