Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms