Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTRB1P17538 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTRB1P17538 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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