Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms