Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TBX18O95935 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBX18O95935 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBX18O95935 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms