Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms