Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms