Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms