Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms