Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms