Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms