Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms