Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms