Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms