Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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COPS9Q8WXC6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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COPS9Q8WXC6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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COPS9Q8WXC6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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COPS9Q8WXC6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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COPS9Q8WXC6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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COPS9Q8WXC6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COPS9Q8WXC6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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