Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms