Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A10Q6U841 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms