Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q6Q795 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms