Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDLIM3Q53GG5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDLIM3Q53GG5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDLIM3Q53GG5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDLIM3Q53GG5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDLIM3Q53GG5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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