Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HFEQ30201 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HFEQ30201 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HFEQ30201 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms