Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PTPRNQ16849 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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