Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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