Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HLFQ16534 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLFQ16534 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms