Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC6Q16204 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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