Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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RYR3Q15413 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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RYR3Q15413 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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RYR3Q15413 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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RYR3Q15413 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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RYR3Q15413 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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