Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms