Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
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