Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms