Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 213.51□□□□□ -0.255e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.325e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)18.26■□□□□ 0.514e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 217.99■□□□□ 0.474e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 517.16■□□□□ 0.344e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-206ENST00000591224 782 ntTSL 215.77■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GIPR-208ENST00000593127 153 ntTSL 510.76□□□□□ -0.694e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 TRAK1-204ENST00000418790 489 ntTSL 49.64□□□□□ -0.874e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GATAD2B-205ENST00000634564 788 ntTSL 58.79□□□□□ -14e-7■■□□□ 13.2
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TARDBPQ13148 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-24■■□□□ 13.2
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TARDBPQ13148 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 214.29□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 13.2
TARDBPQ13148 GTPBP4-205ENST00000491635 2220 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-6■■□□□ 13.2
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TARDBPQ13148 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 214.45□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-7■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 PDZD8-204ENST00000489491 289 ntTSL 23.62□□□□□ -1.834e-7■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-10■■□□□ 13.1
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TARDBPQ13148 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 13.1
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TARDBPQ13148 C7orf49-207ENST00000477820 531 ntTSL 311.82□□□□□ -0.524e-7■■□□□ 13.1
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TARDBPQ13148 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.564e-6■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.914e-6■■□□□ 13.1
TARDBPQ13148 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DNAJC7-211ENST00000588814 1719 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DNAJC7-207ENST00000586335 579 ntTSL 36.72□□□□□ -1.332e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DNAJC7-220ENST00000590847 441 ntTSL 23.73□□□□□ -1.812e-6■■□□□ 13
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TARDBPQ13148 AP2M1-216ENST00000472560 910 ntTSL 214.7□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 13
TARDBPQ13148 AP2M1-206ENST00000432591 802 ntTSL 511.05□□□□□ -0.641e-8■■□□□ 13
TARDBPQ13148 AP2M1-221ENST00000490151 570 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-8■■□□□ 13
TARDBPQ13148 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 213.29□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 13
TARDBPQ13148 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 29.14□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 13
TARDBPQ13148 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 ZNF529-AS1-204ENST00000592880 452 ntTSL 25.36□□□□□ -1.551e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 223.26■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 222.83■■□□□ 1.251e-6■■□□□ 13
TARDBPQ13148 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.899e-7■■□□□ 13
TARDBPQ13148 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-13■■□□□ 13
TARDBPQ13148 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-12■■□□□ 13
TARDBPQ13148 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 523.11■■□□□ 1.294e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-208ENST00000565282 1247 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-206ENST00000563753 599 ntTSL 215.88■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-205ENST00000484580 919 ntTSL 315□□□□□ -0.014e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-209ENST00000565325 858 ntTSL 214.86□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-207ENST00000564551 586 ntTSL 314.51□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 12.9
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