Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms