Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NHLH2Q02577 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms