Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ID3Q02535 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ID3Q02535 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms