Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CBX1P83916 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CBX1P83916 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX1P83916 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX1P83916 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX1P83916 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX1P83916 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX1P83916 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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