Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBP5P82980 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBP5P82980 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RBP5P82980 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBP5P82980 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBP5P82980 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBP5P82980 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBP5P82980 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBP5P82980 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms