Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK-9P63128 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-9P63128 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms