Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms