Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP98P52948 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP98P52948 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP98P52948 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms