Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms