Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms