Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms