Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms