Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms