Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms