Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms