Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARHGAP28Q9P2N2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms