Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms